Jezerska dolina ima zelo pestro geološko preteklost. Savinjske Alpe so nastale z nalaganjem usedlin pred 200 milijoni let. 60 milijonov let pred našim štetjem so se nato dvignile zaradi velikih pritiskov. Jezerski dolini so dokončno podobo dali ledeniki, ki so izginili pred skoraj 10.000 leti zaradi otoplitve. Dolino je zaradi nepropustnosti dna zalila voda, tukaj je bilo ledeniško jezero, ki pa je odteklo pred okoli 500 leti. Nahajališče lehnjaka se razteza na štirih hektarjih v dolini Komatevre, kjer izvira reka Kokra. Kamnolom lehnjaka je nastajal v kvartarju, ki je zadnja geološka doba. Debelina lehnjaka je do 20 metrov, njegova kvaliteta pa je odvisna od velikosti luknjic. Nastaja približno tako kot kapnik iz vodnih raztopin. Fosile lahko vidimo v vseh odlomljenih kameninah.